Η Χειρουργική Κλινική χορηγεί πλήρη ειδικότητα Γενικής Χειρουργικής από το 1989. Το εκπαιδευτικό πρόγραμμα περιλαμβάνει συμβατικές και λαπαροσκοπικές επεμβάσεις, ενδοσκοπήσεις πεπτικού, ενδοκλινικά μαθήματα, βιβλιογραφική ενημέρωση, συμμετοχή σε συνέδρια με ανακοινώσεις , συμμετοχή σε ερευνητικά πρωτόκολλα, συμμετοχή σε διεθνή και ελληνικά course, συμμετοχή στα μαθήματα της ΧΕΒΕ, τήρηση καθηκοντολογίου και πίνακα επεμβάσεων, χρήση πληροφορικής και ειδικά του ηλεκτρονικού φακέλου ασθενούς, εκπαίδευση στον εξομοιωτή, εξοικείωση με υψηλή βιοτεχνολογία (ραδιοκύματα, πυρηνική ιατρική, νέες πηγές ενέργειας)